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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

广深港高铁香港段即将恢复通车 广铁各部门准备就绪******

　　中新社广州1月14日电 (郭军 胡靖)广深港高铁福田至香港西九龙段将于1月15日逐步恢复运营。记者14日从广铁集团了解到，为确保广深港高铁福田至香港西九龙段顺利恢复运营，广铁集团加强人员培训、设备检修，全力以赴做足准备工作。

　　广铁集团客运部介绍，广深港高铁福田至香港西九龙段恢复运营初期，铁路部门将安排开行广州、深圳地区往香港西九龙方向的跨境高铁列车，日均开行高铁动车组旅客列车38.5对。

　　广州动车段迅速抽调业务骨干，扎实做好动车组整备、安全风险研判、应急处置演练等工作，并制定专项培训方案，组织担当广深港高铁值乘工作的动车组随车机械师开展业务培训。此外，加强动车组检修和消毒工作。广州电务段对信号设备进行全覆盖调阅，利用电务8D系统，24小时监测分析，确保及时掌握设备运用状态。

　　广州南站、广州东站、深圳北站、福田站等车站，积极组织客运员开展业务培训，结合跨境旅客群体特征，开展普通话、英语、粤语培训。针对跨境列车将全面实行电子客票，各车站对进站实名制人脸识别闸机、自动售(取)票机等设备进行调试升级。

　　广铁公安局在福田、深圳北、广州南、广州东站储备应急机动力量，随时做好应急增援准备。同时，做好列车治安管控，按照“一车一警”的要求，统筹安排值乘警力，加强车厢巡逻、隐患排查。(完)

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）